Notre Equipe
Guillaume BECARD
Responsable de l’équipe - Pr UPS
rf.es1600673100lt-sp1600673100u.vsr1600673100l@dra1600673100ceb1600673100
Christophe ROUX
Professeur UPS
rf.es1600673100lt-sp1600673100u.vsr1600673100l@xuo1600673100r1600673100
Virginie PUECH-PAGES
Maître de conférences UPS
rf.es1600673100lt-sp1600673100u.vsr1600673100l@hce1600673100up1600673100
Nathalie SEJALON-DELMAS
Maître de conférences UPS
Soizic ROCHANGE
Maître de conférences UPS
rf.es1600673100lt-sp1600673100u.vsr1600673100l@egn1600673100ahcor1600673100
Nicolas FREI DIT FREY
Maître de conférences UPS
rf.es1600673100lt-sp1600673100u.vsr1600673100l@yer1600673100f-tid1600673100-ierf1600673100
Pierre-Marc DELAUX
Chargé de recherche CNRS
Jean-Malo COUZIGOU
Chargé de recherche CNRS
Francis CARBONNE
Assistant ingénieur CNRS
rf.es1600673100lt-sp1600673100u.vsr1600673100l@enn1600673100obrac1600673100
Loïc CUSANT
Doctorant
rf.es1600673100lt-sp1600673100u.vsr1600673100l@tna1600673100suc.c1600673100iol1600673100
Tatiana VERNIE
Post-Doctorante
Mélanie RICH
Post-Doctorante
rf.es1600673100lt-sp1600673100u.vsr1600673100l@hci1600673100r.ein1600673100alem1600673100
Cyril LIBOUREL
Post-Doctorant
Jean KELLER
Post-Doctorant
rf.es1600673100lt-sp1600673100u.vsr1600673100l@rel1600673100lek.n1600673100aej1600673100
Nicolas VIGNERON
Doctorant
Arthur QuyManh MAËS
Doctorant
rf.es1600673100lt-sp1600673100u.vsr1600673100l@sea1600673100m.ruh1600673100tra1600673100
Camille GIROU
Assistant-Ingénieur (CDD)
rf.es1600673100lt-sp1600673100u.vsr1600673100l@uor1600673100ig.el1600673100limac1600673100
Quentin TAULERA
Doctorant
Anciens membres
| Dominique LAURESSERGUES (doctorant) Laurent KAMEL (doctorant) Morgane LE MARQUER (doctorante) Adeline BASCAULES (CDD ingénieur d’études CNRS) Bruno GUILLOTIN (doctorant) Pierre Marc DELAUX (doctorant) Marion MOLES (CDD ingénieur d’études UPS) Damien FORMEY DE SAINT LOUVENT (doctorant) Jérôme LAPARRE (doctorant) Coline BALZERGUE (doctorante) Johann LOUARN (doctorant) Betty GILBERT (post-doctorante) |
Nianwu TANG (doctorant) Carole BASSA (post doctorante) Mohammad ETEMADI (doctorant) Julie BENEDETTI (CDD assistante ingénieur UPS) Mathilde MALBREIL (doctorante) Olivier ANDRE (CDD ingénieur de valorisation Toulouse Tech Transfer) Camille RIBEYRE (CDD technicienne de valorisation Toulouse Tech Transfer) Jean Malo COUZIGOU (post-doctorant) Alexandra HAOUY (CDD ingénieur d’études UPS)
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Thèmes de Recherche
L’équipe étudie une symbiose végétale plante-champignon qui a joué un rôle fondamental dans l’évolution des plantes et qui aujourd’hui encore améliore la santé et la nutrition de la majorité des plantes terrestres. Elle cherche à comprendre comment se déroule la mise en place de cette symbiose aux niveaux cellulaire et moléculaire les plus intimes et à exploiter les connaissances fondamentales acquises pour promouvoir l’utilisation de cette symbiose en agriculture durable.
La plupart des plantes s’associent avec des champignons symbiotiques bénéfiques, les champignons mycorhiziens à arbuscules (MA). Cette interaction très répandue implique des échanges de nutriments via des structures spécialisées produites par le champignon dans les cellules corticales des racines, appelées arbuscules. En échange de molécules organiques fournies par la plante, le champignon apporte à sa plante hôte de l’eau et des minéraux, améliorant ainsi sa nutrition et sa croissance. La symbiose MA apporte d’autres bénéfices aux plantes, notamment une meilleure résistance à divers stress.
Notre objectif principal est d’étudier les mécanismes cellulaires et moléculaires impliqués dans la mise en place de l’interaction symbiotique. Nous pensons que l’étude de cette très ancienne symbiose peut nous faire découvrir des mécanismes ancestraux du fonctionnement des plantes et de leurs interactions avec les microorganismes. Nos recherches sont également conduites pour promouvoir l’utilisation des champignons MA en agriculture durable et réduire ainsi les besoins en irrigation et en intrants chimiques.
Champignon mycorhizien Rhizophagus irregularis en association avec des racines cultivées in vitro. Barre d’échelle = 500 µm
Racine colonisée par le champignon mycorhizien Rhizophagus irregularis.
Les structures fongiques (arbuscules et hyphes intercellulaires) sont colorées en vert. Barre d’échelle = 100 µm.
Projets en cours :
L’équipe composée d’une quinzaine de personnes développe 5 axes de recherche fondamentale interconnectés :
- Nous avons contribué à la découverte de signaux moléculaires importants produits par les racines des végétaux, les strigolactones, et par les champignons MA, les Myc-LCOs/COs. Nous étudions plus précisément les rôles et les mécanismes d’action de ces signaux lors des différentes étapes de la symbiose MA.
- Nous cherchons également à découvrir de nouveaux facteurs de régulation végétaux et fongiques contrôlant l’établissement et l’homéostasie de la symbiose (microARNs, effecteurs, peptides, hormones, métabolites secondaires, facteurs de transcription).
- Nous étudions les facteurs trophiques impliqués dans la biotrophie obligatoire des champignons MA, et l’incidence de cette dépendance trophique sur le fonctionnement des réseaux mycéliens.
- Nous nous intéressons aux processus évolutifs qui ont conduit les plantes à s’associer aux champignons MA (mycorhization) mais aussi à certaines bactéries fixatrices d’azote (nodulation).
- Nous conduisons également des études de biodiversité de la flore mycorhizienne sur des sites plus ou moins anthropisés.
Enfin, nous contribuons à des projets de R & D avec des partenaires industriels afin d’identifier les traits génétiques des champignons MA qui conditionnent leur efficacité agronomique, de mieux comprendre la dépendance mycorhizienne des plantes, et à terme de promouvoir l’utilisation des champignons MA dans les productions végétales.
Pour tout cela nous combinons des approches globales (génomiques, phylogénomiques, transcriptomiques, micro-transcriptomiques, métabolomiques) et plus spécifiques (physiologiques, génétiques, moléculaires, cellulaires, biochimiques).
Publications
2019
Hufnagel B, Marques A, Soriano A, Marquès L, Divol F, Doumas P, Sallet E, Mancinotti D, Carrere S, Marande W, Arribat S, Keller J, Huneau C, Blein T, Aime D, Laguerre M, Taylor J, Schubert V, Nelson M, Geu-Flores F, Crespi M, Gallardo-Guerrero K, Delaux P-M, Salse J, Bergès H, Guyot R, Gouzy J, Péret B. (2019) Genome sequence of the cluster root forming white lupin. Nature Communication, doi.org/10.1101/708917
Girardin A, Wang T, Ding Y, Keller J, Buendia L, Gaston M, Ribeyre C, Gasciolli V, Auriac MC, Vernié T, Bendahmane A, Ried MK, Parniske M, Morel P, Vandenbussche M, Schorderet M, Reinhardt D, Delaux P-M, Bono JJ and Lefebvre L (2019) LCO receptors involved in arbuscular mycorrhiza are functional for rhizobia perception in legumes. Current Biol. In press
Volpe V, Carotenuto G, Berzero C, Cagnina L, Puech-Pagès V, Genre A (2019) Short chain chito-oligosaccharides promote arbuscular mycorrhizal colonization in Medicago truncatula. Carbohydrate research. In press
Cheng S, Xian W, Fu Y, Marin B, Keller J, Wu T, Sun W, Li X, Xu Y, Zhang Y, Wittek S, Reder T, Günther G, Gontcharov A, Wang S, Li L, Liu X, Wang J, Yang H, Xu X, Delaux P-M, Melkonian B, Wong GKS, Melkonian M (2019) Genomes of subaerial Zygnematophyceae provide insights into land plant evolution. Cell. Sous presse
Leroy C, QuyManh Maes A, Louisanna E, Sejalon-Delmas N (2019) How significant are endophytic fungi in bromeliad seeds and seedlings? Effects on germination, survival and performance of two epiphytic plant species. Fungal Ecology 39:296-306. doi: 10.1016/j.funeco.2019.01.004
Pellegrin C, Daguerre Y, Ruytinx J, Guinet F, Kemppainen M, Frei dit Frey N, Puech-Pagès V, Hecker A, Pardo AG, Martin FM, Veneault-Fourrey C (2019). Laccaria bicolor MiSSP8 is a small-secreted protein decisive for the establishment of the ectomycorrhizal symbiosis. Environ Microbiol. 2019 Oct;21(10):3765-3779. doi: 10.1111/1462-2920.14727
Delaux P-M*, Hetherington AJ, Coudert Y, Delwiche C, Dunand C, Gould S, Kenrick P, Li FW, Philippe H, Rensing SA, Rich M, Strullu-Derrien C, de Vries J (2019) Reconstructing trait evolution: A guideline for plant evo-devo studies (and beyond). Current Biology, accepted
de Saint Germain A, Retailleau P, Norsikian S, Servajean V, Pelissier F, Steinmetz V, Pillot JP, Rochange S, Pouvreau JB, Boyer FD (2019) Contalactone, a contaminant formed during chemical synthesis of the strigolactone reference GR24 is also a strigolactone mimic. Phytochemistry 168:112112. doi: 10.1016/j.phytochem.2019.112112.
Cope KR, Bascaules A, Irving TB, Venkateshwaran M, Maeda J, Garcia K, Rush TA, Mad C, Labbé J, Jawdy S, Steigerwald E, Setzke J, Fung E, Schnell KG, Wang Y, Schlief N, Bücking H, Strauss StH, Maillet F, Jargeat P, Bécard G, Puech-Pagès V, Ané JM (2019) The Ectomycorrhizal Fungus Laccaria bicolor Produces Lipochitooligosaccharides and Uses the Common Symbiosis Pathway to Colonize Populus. Plant Cell, DOI: 10.1105/tpc.18.00676
Le Marquer M, Bécard G, Frei dit Frey N (2019) Arbuscular mycorrhizal fungi possess a CLAVATA3/Endosperm surrounding region-related gene that positively regulates symbiosis. New Phytol 222:1030-1042
Morin E, Miyauchi S, San Clemente H, Chen ECH, Pelin A, de la Providencia I, Ndikumana S, Beaudet D, Hainaut M, Drula E, Kuo A, Tang N, Roy S, Viala J, Henrissat B, Grigoriev IV, Corradi N*, Roux C*, Martin F* (2019) Comparative genomics of Rhizophagus irregularis, R. cerebriforme, R. diaphanus and Gigaspora rosea highlights specific genetic features in Glomeromycotina. New Phytol 222: 1584–1598
Le Marquer M, San Clemente H, Roux C, Savelli B, Frei Dit Frey N (2019) Identification of new signalling peptides through a genome-wide survey of 250 fungal secretomes. BMC Genomics. 20(1):64. doi: 10.1186/s12864-018-5414-2
2018
Valdés-López O, Jayaraman D, Maeda J, Delaux P-M, Venkateshwaran M, Isidra-Arellano MC, del Rocío Reyero-Saavedra M, del Socorro Sánchez-Correa M, Verastegui-Vidal MA, Delgado-Buenrostro N, Van Ness L, Mysore KS, Wen J, Sussman MR, Ané JM. (2018) A Novel Positive Regulator of the Early Stages of the Root Nodule Symbiosis Identified by Phosphoproteomics. Plant Cell Physiol. pcy228, https://doi.org/10.1093/pcp/pcy228
Magne K, Couzigou JM, Schiessl K, Liu S, George J, Zhukov V, Sahl L, Boyer F, Iantcheva A, Mysore KS, Wen J, Citerne S, Oldroyd GED and Ratet P (2018) MtNODULE ROOT1 and MtNODULE ROOT2 are essential for Medicago truncatula indeterminate nodule identity. Plant Physiol: 178(1):295-316
Van Deynze A*, Zamora P*, Delaux PM*, Heitmann C*, Gibson D, Schwartz KD, Berry AM, Graham D, Jayaraman D, Rajasekar S, Maeda J, Bhatnagar S, Jospin G, Darling A, Jeannotte R, Lopez J, Weimer BC, Eisen JA, Shapiro HY, Ané JM, Bennett AB (2018) Nitrogen fixation in a landrace of maize is supported by a mucilage-associated diazotrophic microbiota. PLoS Biol. 16(8): e2006352
Nishiyama T, Sakayama H, de Vries J, Buschmann H, Saint-Marcoux D, Ullrich K, Haas FB, Vanderstraeten L, Becker D, Lang D, Vosolsobě S, Rombauts S, Wilhelmsson PKI, Janitza P, Kern R, Heyl A, Rümpler F, Calderón Villalobos LIA, Clay JM, Skokan R, Toyoda A, Suzuki Y, Kagoshima H, Schijlen E, Tajeshwar N, Catarino B, Hetherington AJ, Saltykova A, Bonnot C, Breuninger H, Symeonidi A, Radhakrishnan GV, Van Nieuwerburgh F, Deforce D, Chang C, Karol KG, HedrichR, Ulvskov P, Glöckner G, Delwiche CF, Petrášek J, Van de Peer Y, Friml J, Beilby M, Dolan L, Kohara Y, Sugano S, Fujiyama A, Delaux PM, Quint M, Theißen G, Hagemann M, Harholt J, Dunand C, Zachgo S, Langdale J, Maumus F, Van Der Straeten D, Gould S, Rensing SA (2018) Chara genome: secondary complexity and implications for plant terrestrialization. Cell: 174(2): 448-464
Mathieu S, Cusant L, Roux C, Corradi N (2018) Arbuscular mycorrhizal fungi: intraspecific diversity and pangenomes. New Phytol: 220(4): 1129-1134
Griesmann M, Chang Y, Liu X, Song Y, Haberer G, Crook MB, Billault-Penneteau B, Lauressergues D, Keller J, Imanishi L, Roswanjaya YP, Kohlen W, Pujic P, Battenberg K, Alloisio N, Liang Y, Hilhorst H, Salgado MG, Hocher V, Gherbi H, Svistoonoff S, Doyle JJ, He S, Xu Y, Xu S, Qu J, Gao Q, Fang X, Fu Y, Normand P, Berry AM, Wall LG, Ané JM, Pawlowski K, Xu X, Yang H, Spannagl M, Mayer KFX, Wong GKS, Parniske M*, Delaux PM*, Cheng S* (2018) Phylogenomics reveals multiple losses of nitrogen-fixing root nodule symbiosis. Science: 361(6398). pii: eaat1743
Li FW, Carretero-Paulet L, Cheng S, de Vries J, Delaux PM, Eily A, Koppers N, Kuo LY, Li Z, Simenc M, Small I, Wafula E, Angarita S, Barker MS, Braeutigam A, Brouwer P, dePamphilis C, Gould S, Hosmani PS, Huang YM, Huettel B, Kato Y, Liu X, Maere S, McDowell R, Mueller LA, Rensing SA, Robison T, Rothfels CJ, Sigel EM, Song Y, Timilsina PR, Van de Peer Y, Wang H, Wilhelmsson PKI, Wolf PG, Xu X, Der JP, Schluepmann H, Wong GKS, Pryer KM (2018) Fern genomes elucidate land plant evolution and cyanobacterial symbioses. Nature Plants: 4(7): 460-472
Rich M, Delaux PM (2018) Taking the step: from Evo-Devo to plant–microbe interaction evolution with the liverwort Marchantia. New Phytol. 218: 1217-1232
Cheng S, Melkonian M, Smith S, Brockington S, Archibald JM, Delaux PM, Li FW, Melkonian B, Mavrodiev EV, Sun W, Fu Y, Yang H, Soltis DE, Graham SW, Soltis PS, Liu X, Xu X, Wong GKS (2018) 10KP: A Phylodiverse Genome Sequencing Plan. GigaScience, 7: 1-9
Vigneron N, Radhakrishnan G, Delaux PM (2018) What have we learnt studying the evolution of the arbuscular mycorrhizal symbiosis? Curr Opin Plant Biol. 44:49-56
Pierart A, Dumat C, Maes AQ, Séjalon-Delmas N (2018) Influence of arbuscular mycorrhizal fungi on antimony phyto-uptake and compartmentation in vegetables cultivated in urban gardens. Chemosphere, 191:272-279
Pierart A, Dumat C, Maes AQ, Roux C, Séjalon-Delmas N (2018) Opportunities and risks of biofertilization for leek production in urban areas: Influence on both fungal diversity and human bioaccessibility of inorganic pollutants. STOTEN, 624:1140-1151
Chen E, Morin E, Beaudet D, Noel J, Yildirir G, Ndikumana S, Charron P, Stonge C, Giorgi J, Kruger M, Marton T, Ropars J, Grigoriex IV, Hainaut M, Henrissat B, Roux C, Martin F & Corradi N (2018) High intraspecific genome diversity in the model arbuscular mycorrhizal symbiont Rhizophagus irregularis. New Phytol. DOI:10.1111/nph.14989
2017
Rich M K, Courty PE, Roux C, & Reinhardt D (2017) Role of the GRAS transcription factor ATA/RAM1 in the transcriptional reprogramming of arbuscular mycorrhiza in Petunia hybrida. BMC genomics, 18(1), 589
Keymer A, Pimprikar P, Wewer V, Huber C, Brands M, Bucerius SL, Delaux PM, Klingl V, Röpenack-Lahaye EV, Wang TL, Eisenreich W, Dörmann P, Parniske M, Gutjahr C (2017) Lipid transfer from plants to arbuscular mycorrhizal fungi. Elife. pii : e29107. doi : 10.7554/eLife.29107
Bécard G (2017) How Plants Communicate with their Biotic Environment, Advances in Botanical Research, Vol 82, 1st Edition, Academic Press, 404 pages
Bécard G & Puech-Pagès V (2017) Communication entre les partenaires dans la symbiose mycorhizienne à arbuscules, in « Les sols et la vie souterraine » – Des enjeux majeurs en agroécologie. J.-F. Briat & D. Job (Coord.), Quae, 328 pages
Bécard G, Guidi L, Alizon S, Angelier F, Bezin L, Bowler C, Courchamp F, Dutreuil S, Faure M, Hibner U, Jebbar M, Kaltz O, Leulier F, Loudet O, Simonet P, Tost J, Vergnolle N (2017) L’être vivant dans son environnement, in « Étonnant vivant – Découvertes et promesses du XXIe siècle », C. Jessus & T. Gaude (Eds.), CNRS Edition, 328 pages
Hérivaux A, de Bernonville TD, Roux C, Clastre M, Courdavault V, Gastebois A, … & Papon N (2017) The Identification of Phytohormone Receptor Homologs in Early Diverging Fungi Suggests a Role for Plant Sensing in Land Colonization by Fungi. mBio, 8(1), e01739-16
Nadal M, Sawers R, Naseem S, Bassin B, Kulicke C, Sharman A, An G, An K, Ahern KR, Romag A, Brutnell TP, Gutjahr C, Geldner N,
Roux C, Martinoia E, Konopka JB & Paszkowski U (2017) An N-acetylglucosamine transporter required for arbuscular mycorrhizal symbioses in rice and maize. Nature Plants (3). doi:10.1038/nplants.2017.73
Zhang R, Calixto CPG, Marquez Y, Venhuizen P, Tzioutziou NA, Guo W, Spensley M, Entizne JC, Lewandowska D, Ten Have S, Frei Dit Frey N, Hirt H, James AB, Nimmo HG, Barta A, Kalyna M, Brown JWS (2017) A high quality Arabidopsis transcriptome for accurate transcript-level analysis of alternative splicing. Nucleic Acids Res. 2017 May 19 ;45(9):5061-5073
Kamel L, Tang N, Malbreil M, San Clemente H, Le Marquer M, Roux C, Frei Dit Frey N (2017) The Comparison of Expressed Candidate Secreted Proteins from Two Arbuscular Mycorrhizal Fungi Unravels Common and Specific Molecular Tools to Invade Different Host Plants. Front Plant Sci. 2017 Feb 7 ;8:124. doi : 10.3389/fpls.2017.00124. eCollection 2017
Couzigou JM, Lauressergues D, André O, Gutjahr C, Guillotin B, Bécard G, Combier JP (2017) Positive Gene Regulation by a Natural Protective miRNA Enables Arbuscular Mycorrhizal Symbiosis. Cell Host Microbe. Dec 14. pii : S1931-3128(16)30490-5. doi : 10.1016/j.chom.2016.12.001
2016
Guillotin B, Couzigou JM, Combier JP (2016) NIN Is Involved in the Regulation of Arbuscular Mycorrhizal Symbiosis. Front Plant Sci. 7:1704.
Gough C & Bécard G (2016) Strigolactones and lipochitooligosaccharides as molecular communication signals in the arbuscular mycorrhizal symbiosis, in « Molecular Mycorrhizal Symbiosis », F. Martin (Ed.), Wiley-Blackwell, 576 pages
Thiéry O, Vasar M, Jairus T, Davison J, Roux C, Kivistik PA, Metspalu A, Milani L, Saks Ü, Moora M, Zobel M, Öpik M (2016) Sequence variation in nuclear ribosomal small subunit, internal transcribed spacer and large subunit regions of Rhizophagus irregularis and Gigaspora margarita is high and isolate‐dependent. Molecular ecology, 25(12), 2816-2832
Delaux PM, Radhakrishnan GV, Jayaraman D, Cheema J, Malbreil M, Volkening JD, Sekimoto H, Nishiyama T, Melkonian M, Pokorny L, Rothfels CJ, Winter Sederoff H, Stevenson DW, Surek B, Zhang Y, Sussman MR, Dunand C, Morris RJ, Roux C, Wong GKS, Oldroyd GED, Ané JM (2016) The algal ancestor of land plants was pre-adapted for symbiosis. PNAS, 112(43), 13390-13395
Kamel L, Keller-Pearson M, Roux C, Ané JM (2016) Biology and evolution of arbuscular mycorrhizal symbiosis in the light of genomics. New Phytol. doi : 10.1111/nph.14263.
Guillotin B, Etemadi M, Audran C, Bouzayen M, Bécard G, Combier JP (2016) Sl-IAA27 regulates strigolactone biosynthesis and mycorrhization in tomato (var. MicroTom). New Phytol. 2016 Oct 17. doi : 10.1111/nph.14246
Delaux PM (2016) Comparative phylogenomics of symbiotic associations. New Phytol Sep 1. doi : 10.1111/nph.14161.
Couzigou JM, Combier JP (2016) Plant microRNAs : key regulators of root architecture and biotic interactions. New Phytol. 2016 Jun 13. doi : 10.1111/nph.14058
Jia KP, Kountche BA, Jamil M, Guo X, Ntui VO, Rüfenacht A, Rochange S, Al-Babili S (2016) Nitro-Phenlactone, a Carlactone Analog with Pleiotropic Strigolactone Activities. Mol Plant. Sep 6 ;9(9):1341-4
Sedzielewska-Toro K, Delaux PM (2016) Mycorrhizal symbioses : today and tomorrow. New Phytol Feb ;209(3):917-20
Couzigou JM, André O, Guillotin B, Alexandre M, Combier JP (2016) Use of microRNA-encoded peptide miPEP172c to stimulate nodulation in soybean. New Phytol. Jul ;211(2):379-81
Tang N, San Clemente H, Roy S, Bécard G, Zhao B, Roux C (2016) A Survey of the Gene Repertoire of Gigaspora rosea Unravels Conserved Features among Glomeromycota for Obligate Biotrophy. Front Microbiol. 2016 Mar 1 ;7:233. doi : 10.3389/fmicb.2016.00233. eCollection 2016.
Delaux PM, Radhakrishnan GV, Jayaraman D, Cheema J, Malbreil M, Volkening JD, Sekimoto H, Nishiyama T, Melkonian M, Pokorny L, Rothfels CJ, Sederoff HW, Stevenson DW, Surek B, Zhang Y, Sussman MR, Dunand C, Morris RJ, Roux C, Wong GK, Oldroyd GE, Ané JM (2015) Algal ancestor of land plants was preadapted for symbiosis. Proc Natl Acad Sci 27 ;112(43) : 13390-5
Couzigou JM, Lauressergues D, Bécard G, Combier JP (2015) miRNA-encoded peptides (miPEPs) : a new tool to analyse the roles of miRNAs in plant biology. RNA Biol 12(11) : 1178-80
Lauressergues D, Couzigou JM, Clemente HS, Martinez Y, Dunand C, Bécard G, Combier JP (2015) Primary transcripts of microRNAs encode regulatory peptides. Nature 520(7545) : 90-3
Mazaheri-Naeini M, Sabbagh SK, Martinez Y, Séjalon-Delmas N, Roux C (2015) Assessment of Ustilago maydis as a fungal model for root infection studies. Fungal Biol 119(2-3) : 145-53
Lauressergues D, André O, Peng J, Wen J, Chen R, Ratet P, Tadege M, Mysore KS, and Rochange SF (2015) Strigolactones contribute to shoot elongation and to the formation of leaf margin serrations in Medicago truncatula R108. J Exp Bot 66(5) : 1237-44
2014
Formey D, Sallet E, Lelandais-Brière C, Ben C, Bustos-Sanmamed P, Niebel A, Frugier F, Combier JP, Debellé F, Hartmann C, Poulain J, Gavory F, Wincker P, Roux C, Gentzbittel L, Gouzy J and Crespi M (2014) The small RNA diversity from Medicago truncatula roots under biotic interactions evidences the environmental plasticity of the miRNAome. Genome Biol 24 ;15(9) : 457.
Cardoso C, Charnikhova T, Jamil M, Delaux PM, Verstappen F, Amini M, Lauressergues D, Ruyter-Spira C, Bouwmeester H (2014) Differential activity of Striga hermonthica seed germination stimulants and Gigaspora rosea hyphal branching factors in rice and their contribution to underground communication. PLoS One doi : 10.1371/journal.pone.0104201. eCollection 2014
Etemadi M*, Gutjahr C*, Couzigou JM, Zouine M, Lauressergues D, Timmers A, Audran C, Bouzayen M, Becard G, Combier JP (2014) Auxin perception is required for arbuscule development in arbuscular mycorrhizal symbiosis. Plant Physiol 166(1) : 281-92
Dore J, Marmeisse R, Combier JP*, Gay G* (2014) A fungal conserved gene from the basidiomycete Hebeloma cylindrosporum is essential for efficient ectomycorrhiza formation. MPMI 27(10) : 1059-69
Boyer FD, de Saint Germain A, Pouvreau JB, Clavé G, Pillot JP, Roux A, Rasmussen A, Depuydt S, Goormachtig S, Lauressergues D, Frei dit Frey N, Heugebaert T, Rameau C (2014) New strigolactone analogues as plant hormones with low activities in the rhizosphere. Mol Plant 7(4) : 675-690
Laparre J*, Malbreil M*, Letisse F, Portais JC, Roux C, Bécard G, Puech-Pagès V (2014) Combining metabolomics and gene expression analysis reveals that propionyl- and butyryl-carnitines are involved in late stages of arbuscular mycorrhizal symbiosis. Mol Plant 7(3) : 554-66
2013
Tisserant E*, Malbreil M*, Kuo A, Kohler A, Symeonidi A, Balestrini R, Charron P, Duensing N, Frei Dit Frey N, Gianinazzi-Pearson V, Gilbert LB, Handa Y, Herr JR, Hijri M, Koul R, Kawaguchi M, Krajinski F, Lammers PJ, Masclaux FG, Murat C, Morin E, Ndikumana S, Pagni M, Petitpierre D, Requena N, Rosikiewicz P, Riley R, Saito K, San Clemente H, Shapiro H, van Tuinen D, Bécard G, Bonfante P, Paszkowski U, Shachar-Hill YY, Tuskan GA, Young PW, Sanders IR, Henrissat B, Rensing SA, Grigoriev IV, Corradi N, Roux C, Martin F (2013) Genome of an arbuscular mycorrhizal fungus provides insight into the oldest plant symbiosis. Proc Natl Acad Sci 10 ;110(50) : 20117-22
Bassa C*, Etemadi M*, Combier JP, Bouzayen M and Audran-Delalande C (2013) Sl-IAA27 gene expression is induced during arbuscular mycorrhizal symbiosis in tomato and in Medicago truncatula. Plant Signal Behav 8(10) : doi : 10.4161/psb.25637
Balzergue C, Chabaud M, Barker DG, Bécard G, Rochange S (2013) High phosphate reduces host ability to develop arbuscular mycorrhizal symbiosis without affecting root calcium spiking responses to the fungus. Front Plant Sci 29 ;4 : 426
Delaux PM, Bécard G and Combier JP (2013) NSP1 is a component of the Myc signaling pathway. New Phytol 199(1) : 59-65
Bazin J, Khan GA, Combier JP, Bustos-Sanmamed P, Debernardi JM, Rodriguez R, Sorin C, Palatnik J, Hartmann C, Crespi M, and Lelandais-Briere C (2013) miR396 affects mycorrhization and root meristem activity in the legume Medicago truncatula. Plant J 74(6) : 920-34
Delaux PM, Séjalon-Delmas N, Bécard G, Ané JM (2013) Evolution of the plant – microbe symbiotic “toolkit”. Trends Plant Sci 18(6) : 298-304
Genre A*, Chabaud M*, Balzergue B, Puech-Pages V, Novero M, Rey T, Fournier J, Rochange S, Bécard G, Bonfante P and Barker DG (2013) Short-chain chitin oligomers from arbuscular mycorrhizal fungi trigger nuclear Ca2+ spiking in Medicago truncatula roots and their production is enhanced by strigolactone. New Phytol 198(1) : 190-202
2012
Louarn J, Carbonne F, Delavault P, Bécard G, Rochange S (2012) Reduced germination of Orobanche cumana seeds in the presence of arbuscular mycorrhizal fungi or their exudates. PLoS ONE 7(11)
Formey D*, Molès M*, Haouy A, Savelli B, Bouchez O, Bécard G and Roux C (2012) Comparative analysis of mitochondrial genomes of Rhizophagus irregularis – syn. Glomus irregulare – reveals a polymorphism induced by variability generating elements. New Phytol 196 (4) : 1217-27
Lauressergues D*, Delaux PM*, Formey D, Lelandais-Brière C, Fort S, Cottaz S, Bécard G, Niebel A, Roux C, Combier JP (2012) The microRNA miR171h modulates arbuscular mycorrhizal colonization of Medicago truncatula by targeting NSP2. Plant J 72 (3) : 512-522
Delaux PM, Xie X, Timme RE, Puech-Pages V, Dunand C, Lecompte E, Delwiche CF, Yoneyama K, Bécard G and Séjalon-Delmas N (2012) Origin of strigolactones in the green lineage. New Phytol 195 (4) : 857-871
Tisserant E, Kohler A, Dozolme-Seddas P, Balestrini R, Benabdellah K, Colard A, Croll D, Da Silva C, Gomez SK, Koul R, Ferrol N, Fiorilli V, Formey D, Franken P, Helber N, Hijri M, Lanfranco L, Lindquist E, Liu Y, Malbreil M, Morin E, Poulain J, Shapiro H, van Tuinen D, Waschke A, Azcón-Aguilar C, Bécard G, Bonfante P, Harrison MJ, Küster H, Lammers P, Paszkowski U, Requena N, Rensing SA, Roux C, Sanders IR, Shachar-Hill Y, Tuskan G, Young JPW, Gianinazzi-Pearson V and Martin F (2012) The transcriptome of the arbuscular mycorrhizal fungus Glomus intraradices (DAOM 197198) reveals functional tradeoffs in an obligate symbiont. New Phytol 193 (3) : 755-69
Delaux PM, Nanda AK, Mathé C, Sejalon-Delmas N, Dunand C (2012) Molecular and biochemical aspects of plant terrestrialization. Perspective in Plant Ecology, Evolution and Systematics 14 : 49-50
2011
Koltai H, Cohen M, Chesin O, Mayzlish-Gati E, Bécard G, Puech V, Ben Dor B, Resnick N, Wininger S, Kapulnik Y (2011) Light is a positive regulator of strigolactone levels in tomato roots. J Plant Physiol 168 (16) : 1993-6
Laparre J, Balzergue C, Rochange S, Ludwiczak P, Letisse F, Portais JC, Bécard G, Puech-Pages V (2011) Metabolite profiling of pea roots in response to phosphate availability. Plant Signal Behav 6 : 837-839
Maillet F, Poinsot V, Andre O, Puech-Pagès V, Haouy A, Gueunier M, Cromer L, Giraudet D, Formey D, Niebel A, Andres Martinez E, Driguez H, Bécard G, Dénarié J (2011) Fungal lipochitooligosaccharidic symbiotic signals in arbuscular mycorrhiza. Nature 3 : 58-63
Balzergue C, Puech-Pages V, Becard G, Rochange SF (2011) The regulation of arbuscular mycorrhizal symbiosis by phosphate in pea involves early and systemic signalling events. J Exp Bot 62 : 1049-60
Kapulnik Y, Delaux PM, Resnick N, Mayzlish-Gati E, Wininger S, Bhattacharya C, Sejalon-Delmas N, Combier JP, Becard G, Belausov E, Beeckman T, Dor E, Hershenhorn J, Koltai H (2011) Strigolactones affect lateral root formation and root-hair elongation in Arabidopsis. Planta 233 : 209-16
Diagne-Leye G, Almaraz-Lopez T, Sy-Ndir M, Mascarell G, Ba AT, Roux C (2010) Systematic position of Moesziomyces penicillariae among Ustilaginaceae. African Journal of Microbiology Research 4 (9) : 740-747
Sabbagh SK, Digne-les-Bains G, Naudan M, Roux C (2010) Solopathogenic strain formation strongly differs among Ustilaginaceae species. FEMS Microbiol Lett 305 (2) : 121-127
2009
Besserer A, Becard G, Roux C, Sejalon-Delmas N (2009) Role of mitochondria in the response of arbuscular mycorrhizal fungi to strigolactones. Plant Signal Behav 4 : 75-77
2008
Gianinazzi-Pearson V, Sejalon-Delmas N, Genre A, Jeandroz S, Bonfante P (2008) Plants and arbuscular mycorrhizal fungi : cues and communication in the early steps of symbiotic interactions. Adv Bot Res 46 : 182-219
Besserer A, Becard G, Jauneau A, Roux C, Sejalon-Delmas N (2008) GR24, a synthetic analog of strigolactones, stimulates the mitosis and growth of the arbuscular mycorrhizal fungus Gigaspora rosea by boosting its energy metabolism. Plant Physiol 148 : 402-413
Gomez-Roldan V, Fermas S, Brewer PB, Puech-Pages V, Dun EA, Pillot JP, Letisse F, Matusova R, Danoun S, Portais JC, Bouwmeester H, Becard G, Beveridge CA, Rameau C, Rochange SF (2008) Strigolactone inhibition of shoot branching. Nature 455 : 189-U122
Lopez-Raez JA, Charnikhova T, Gomez-Roldan V, Matusova R, Kohlen W, De Vos R, Verstappen F, Puech-Pages V, Becard G, Mulder P, Bouwmeester H (2008) Tomato strigolactones are derived from carotenoids and their biosynthesis is promoted by phosphate starvation. New Phytol 178 : 863-874
2007
Gomez-Roldan V, Roux C, Girard D, Becard G, Puech-Pages V (2007) Strigolactones : promising plant signals. Plant Signal Behav 2 : 163-164
Bouwmeester HJ, Roux C, Lopez-Raez JA, Becard G (2007) Rhizosphere communication of plants, parasitic plants and AM fungi. Trends Plant Sci 12 : 224-230
Lumini E, Bianciotto V, Jargeat P, Novero M, Salvioli A, Faccio A, Becard G, Bonfante P (2007) Presymbiotic growth and sporal morphology are affected in the arbuscular mycorrhizal fungus Gigaspora margarita cured of its endobacteria. Cell Microbiol 9 : 1716-1729
Besserer A, Puech-Pages V, Kiefer P, Gomez-Roldan V, Jauneau A, Roy S, Portais JC, Roux C, Becard G, Sejalon-Delmas N (2006) Strigolactones stimulate arbuscular mycorrhizal fungi by activating mitochondria. Plos Biol 4 : 1239-1247
2005
Guimil S, Chang HS, Zhu T, Sesma A, Osbourn A, Roux C, Ioannidis V, Oakeley EJ, Docquier M, Descombes P, Briggs SP, Paszkowski U (2005) Comparative transcriptomics of rice reveals an ancient pattern of response to microbial colonization. Proc Natl Acad Sci 10 (22) : 8066-8070
De Souza F. A., Séjalon-Delmas N (2005) Life history strategies in Gigasporaceae : insight from monoxenic cultures. In Mycorrhizas on root-organ culture, Series : Soil Biology, Dr. Ajit K. Varma, S. Declerck, D.G. Strullu, J.A. Fortin Eds.
De la Providencia I, Adriano de Souza F, Fernandez F, Séjalon-Delmas N, Declerck S (2005) Arbuscular mycorrhizal fungi reveal distinct pattern of anastomoses formation and hyphal healing mechanism between different phylogenetic groups. New Phytol 165 : 261-271
Olah B, Briere C, Becard G, Denarie J, Gough C (2005) Nod factors and a diffusible factor from arbuscular mycorrhizal fungi stimulate lateral root formation in Medicago truncatula via the DMI1/DMI2 signalling pathway. Plant J 44 : 195-207
Trepanier M, Becard G, Moutoglis P, Willemot C, Gagne S, Avis TJ, Rioux JA (2005) Dependence of arbuscular-mycorrhizal fungi on their plant host for palmitic acid synthesis. Appl Environ Microbiol 71 : 5341-5347
2004
Becard G, Kosuta S, Tamasloukht M, Sejalon-Delmas N, Roux C (2004) Partner communication in the arbuscular mycorrhizal interaction. Can J Bot – Rev Can Bot 82 : 1186-1197
Bianciotto V, Genre A, Jargeat P, Lumini E, Becard G, Bonfante P (2004) Vertical transmission of endobacteria in the arbuscular mycorrhizal Fungus gigaspora margarita through generation of vegetative spores. Appl Environ Microbiol 70 : 3600-3608
Jargeat P, Cosseau C, Ola’h B, Jauneau A, Bonfante P, Batut J, Becard G (2004) Isolation, free-living capacities, and genome structure of « Candidatus glomeribacter gigasporarum, » the endocellular bacterium of the mycorrhizal fungus Gigaspora margarita. J Bacteriol 186 : 6876-6884
2003
Jolicoeur M, Bouchard-Marchand E, Becard G, Perrier M (2003) Regulation of mycorrhizal symbiosis : development of a structured nutritional dual model. Ecological Modelling 158 : 121
Kosuta S, Chabaud M, Lougnon G, Gough C, Denarie J, Barker DG, Becard G (2003) A diffusible factor from arbuscular mycorrhizal fungi induces symbiosis-specific MtENOD11 expression in roots of Medicago truncatula. Plant Physiol 131 : 952-962
Martinez C, Roux C, Jauneau A, Becard G, Dargent R (2003) Effect of water potential on the development of an haploid strain of Sporisorium reilianum f.sp zeae. Plant and Soil 251 : 65-71
Tamasloukht M, Sejalon-Delmas N, Kluever A, Jauneau A, Roux C, Becard G, Franken P (2003) Root factors induce mitochondrial-related gene expression and fungal respiration during the developmental switch from asymbiosis to presymbiosis in the arbuscular mycorrhizal fungus Gigaspora rosea. Plant Physiol 131 : 1468-1478
Gianinazzi-Pearson, V., Azcon-Aguilar, C., Bécard, G., Bonfante, P., Ferrol, N., Franken, P., Gollotte, A., Harrier, L.A., Lanfranco, L. & van Tuinen, D (2003) Structural and functional genomics of symbiotic arbuscular mycorrhizal fungi . In : Advances in fungal biotechnology for industry, agriculture, and medicine, JS Tkacz, L Lange (eds). Kluwer Academic/Plenum Publishers, p 405-419
Thèses
Laurent Kamel Université Paul Sabatier, Toulouse III. Les petits peptides sécrétés des champignons mycorhiziens à arbuscules, sésames de la biotrophie ?
Bruno Guillotin Université Paul Sabatier, Toulouse III. Autorégulation de la symbiose mycorhizienne à arbuscules.
Mohammad Etemadi (2014) Université Paul Sabatier, Toulouse III / ENSAT. Implication de l’auxine dans la symbiose endomycorhizienne à arbuscule chez la tomtate. (pdf)
Nianwu Tang Université Paul Sabatier, Toulouse III / Université Hua Zhong Agricultural (Chine). Transcriptomic analysis of Gigaspora.
Mathilde Malbreil (2014) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Le dialogue moléculaire pendant la symbiose endomycorhizienne : perception et émission de signaux symbiotiques par le champignon Glomus intraradices . (pdf)
Johann Louarn (2013) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Exploitation de la symbiose endomycorhizienne pour l’amélioration de la résistance à l’Orobanche chez le tournesol.
Coline Balzergue (2013) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Régulation de la symbiose endomycorhizienne par le partenaire végétal. (pdf)
Damien Formey De Saint Louvent (2012) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Analyse du génome de Glomus intraradices et étude de la régulation génique chez le champignon et la plante hôte lors de l’établissement de la symbiose endomycorhizienne. (pdf)
Jérôme Laparre (2012) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Dynamique métabolique de l’établissement de la symbiose obligatoire des champignons mycorhiziens à arbuscules. (pdf)
Pierre-Marc Delaux (2011) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Contenu en strigolactones du maïs. Recherche de nouvelles strigolactones chez les organismes photosynthétiques ancestraux. (pdf)
Maria-Victoria Gomez-Roldan (2008) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Rôle des strigolactones dans la symbiose mycorhizienne à arbuscules. (pdf)
Arnaud Besserer (2008) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Étude des mécanismes d’action des strigolactones sur les champignons endomycorhiziens à arbuscules. (pdf)
Seyed Kazem Sabbagh (2008) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Adaptation à la pénétration racinaire de deux Ustilaginaceae parasites du maïs : Ustilago maydis et Sporisorium reilianum – Analyse microscopique et transcriptomique. (pdf)
Sonja Kosuta (2003) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Des facteurs diffusibles, produits par les champignons mycorhiziens à arbuscules, induisent des réponses symbiotiques au niveau des racines de Medicago truncatula.
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