Notre Equipe
Guillaume BECARD
Responsable de l’équipe - Pr UPS
Christophe ROUX
Professeur UPS
Virginie PUECH-PAGES
Maître de conférences UPS
Nathalie SEJALON-DELMAS
Maître de conférences UPS
Soizic ROCHANGE
Maître de conférences UPS
Nicolas FREI DIT FREY
Maître de conférences UPS
Pierre-Marc DELAUX
Chargé de recherche CNRS
Jean-Malo COUZIGOU
Chargé de recherche CNRS
Francis CARBONNE
Assistant ingénieur CNRS
Loïc CUSANT
Doctorant
Tatiana VERNIE
Post-Doctorante
Mélanie RICH
Post-Doctorante
Cyril LIBOUREL
Post-Doctorant
Jean KELLER
Post-Doctorant
Nicolas VIGNERON
Doctorant
Arthur QuyManh MAËS
Doctorant
Camille GIROU
Assistant-Ingénieur (CDD)
Quentin TAULERA
Doctorant
Anciens membres
| Dominique LAURESSERGUES (doctorant) Laurent KAMEL (doctorant) Morgane LE MARQUER (doctorante) Adeline BASCAULES (CDD ingénieur d’études CNRS) Bruno GUILLOTIN (doctorant) Pierre Marc DELAUX (doctorant) Marion MOLES (CDD ingénieur d’études UPS) Damien FORMEY DE SAINT LOUVENT (doctorant) Jérôme LAPARRE (doctorant) Coline BALZERGUE (doctorante) Johann LOUARN (doctorant) Betty GILBERT (post-doctorante) |
Nianwu TANG (doctorant) Carole BASSA (post doctorante) Mohammad ETEMADI (doctorant) Julie BENEDETTI (CDD assistante ingénieur UPS) Mathilde MALBREIL (doctorante) Olivier ANDRE (CDD ingénieur de valorisation Toulouse Tech Transfer) Camille RIBEYRE (CDD technicienne de valorisation Toulouse Tech Transfer) Jean Malo COUZIGOU (post-doctorant) Alexandra HAOUY (CDD ingénieur d’études UPS)
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Thèmes de Recherche
L’équipe étudie une symbiose végétale plante-champignon qui a joué un rôle fondamental dans l’évolution des plantes et qui aujourd’hui encore améliore la santé et la nutrition de la majorité des plantes terrestres. Elle cherche à comprendre comment se déroule la mise en place de cette symbiose aux niveaux cellulaire et moléculaire les plus intimes et à exploiter les connaissances fondamentales acquises pour promouvoir l’utilisation de cette symbiose en agriculture durable.
La plupart des plantes s’associent avec des champignons symbiotiques bénéfiques, les champignons mycorhiziens à arbuscules (MA). Cette interaction très répandue implique des échanges de nutriments via des structures spécialisées produites par le champignon dans les cellules corticales des racines, appelées arbuscules. En échange de molécules organiques fournies par la plante, le champignon apporte à sa plante hôte de l’eau et des minéraux, améliorant ainsi sa nutrition et sa croissance. La symbiose MA apporte d’autres bénéfices aux plantes, notamment une meilleure résistance à divers stress.
Notre objectif principal est d’étudier les mécanismes cellulaires et moléculaires impliqués dans la mise en place de l’interaction symbiotique. Nous pensons que l’étude de cette très ancienne symbiose peut nous faire découvrir des mécanismes ancestraux du fonctionnement des plantes et de leurs interactions avec les microorganismes. Nos recherches sont également conduites pour promouvoir l’utilisation des champignons MA en agriculture durable et réduire ainsi les besoins en irrigation et en intrants chimiques.
Champignon mycorhizien Rhizophagus irregularis en association avec des racines cultivées in vitro. Barre d’échelle = 500 µm
Racine colonisée par le champignon mycorhizien Rhizophagus irregularis.
Les structures fongiques (arbuscules et hyphes intercellulaires) sont colorées en vert. Barre d’échelle = 100 µm.
Projets en cours :
L’équipe composée d’une quinzaine de personnes développe 5 axes de recherche fondamentale interconnectés :
- Nous avons contribué à la découverte de signaux moléculaires importants produits par les racines des végétaux, les strigolactones, et par les champignons MA, les Myc-LCOs/COs. Nous étudions plus précisément les rôles et les mécanismes d’action de ces signaux lors des différentes étapes de la symbiose MA.
- Nous cherchons également à découvrir de nouveaux facteurs de régulation végétaux et fongiques contrôlant l’établissement et l’homéostasie de la symbiose (microARNs, effecteurs, peptides, hormones, métabolites secondaires, facteurs de transcription).
- Nous étudions les facteurs trophiques impliqués dans la biotrophie obligatoire des champignons MA, et l’incidence de cette dépendance trophique sur le fonctionnement des réseaux mycéliens.
- Nous nous intéressons aux processus évolutifs qui ont conduit les plantes à s’associer aux champignons MA (mycorhization) mais aussi à certaines bactéries fixatrices d’azote (nodulation).
- Nous conduisons également des études de biodiversité de la flore mycorhizienne sur des sites plus ou moins anthropisés.
Enfin, nous contribuons à des projets de R & D avec des partenaires industriels afin d’identifier les traits génétiques des champignons MA qui conditionnent leur efficacité agronomique, de mieux comprendre la dépendance mycorhizienne des plantes, et à terme de promouvoir l’utilisation des champignons MA dans les productions végétales.
Pour tout cela nous combinons des approches globales (génomiques, phylogénomiques, transcriptomiques, micro-transcriptomiques, métabolomiques) et plus spécifiques (physiologiques, génétiques, moléculaires, cellulaires, biochimiques).
Publications
2019
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2018
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Theses
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Nianwu Tang Université Paul Sabatier, Toulouse III / Université Hua Zhong Agricultural (Chine). Transcriptomic analysis of Gigaspora.
Mathilde Malbreil (2014) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Le dialogue moléculaire pendant la symbiose endomycorhizienne : perception et émission de signaux symbiotiques par le champignon Glomus intraradices . (pdf)
Johann Louarn (2013) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Exploitation de la symbiose endomycorhizienne pour l’amélioration de la résistance à l’Orobanche chez le tournesol.
Coline Balzergue (2013) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Régulation de la symbiose endomycorhizienne par le partenaire végétal. (pdf)
Damien Formey De Saint Louvent (2012) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Analyse du génome de Glomus intraradices et étude de la régulation génique chez le champignon et la plante hôte lors de l’établissement de la symbiose endomycorhizienne. (pdf)
Jérôme Laparre (2012) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Dynamique métabolique de l’établissement de la symbiose obligatoire des champignons mycorhiziens à arbuscules. (pdf)
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Maria-Victoria Gomez-Roldan (2008) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Rôle des strigolactones dans la symbiose mycorhizienne à arbuscules. (pdf)
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Seyed Kazem Sabbagh (2008) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Adaptation à la pénétration racinaire de deux Ustilaginaceae parasites du maïs : Ustilago maydis et Sporisorium reilianum – Analyse microscopique et transcriptomique. (pdf)
Sonja Kosuta (2003) Université Paul Sabatier, Toulouse III. Des facteurs diffusibles, produits par les champignons mycorhiziens à arbuscules, induisent des réponses symbiotiques au niveau des racines de Medicago truncatula.
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