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PeroxiBase

L’annotation automatique du génome complet de nombreux organismes et la classification automatique et l’assemblage de séquences EST ont permis d’identifier de nombreuses séquences codant pour les différentes familles et superfamilles de peroxydases. Toutefois, le traitement automatique des séquences est connu pour être parfois de mauvaise qualité.

En utilisant les motifs hautement conservés de chaque catégorie de peroxydases, l’annotation et l’édition manuelles permettent d’identifier correctement les séquences complètes, même dans les séquences de faible qualité, de mettre à jour des séquences existantes et d’accroître le nombre de séquences annotées.

L’objectif de la base de données PeroxiBase est de centraliser la plupart des séquences codant pour les superfamilles de peroxydase, de suivre l’évolution des peroxydases chez les organismes vivants et de compiler les informations concernant leurs fonctions putatives et leurs régulations transcriptionnelle.

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